Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Opn1mwO35599 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Opn1mwO35599 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Opn1mwO35599 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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