Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MEFVO15553 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEFVO15553 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEFVO15553 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEFVO15553 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEFVO15553 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEFVO15553 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEFVO15553 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEFVO15553 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MEFVO15553 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEFVO15553 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEFVO15553 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEFVO15553 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEFVO15553 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEFVO15553 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MEFVO15553 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEFVO15553 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEFVO15553 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEFVO15553 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEFVO15553 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEFVO15553 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MEFVO15553 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MEFVO15553 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MEFVO15553 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MEFVO15553 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MEFVO15553 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MEFVO15553 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MEFVO15553 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MEFVO15553 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEFVO15553 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEFVO15553 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MEFVO15553 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEFVO15553 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEFVO15553 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEFVO15553 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEFVO15553 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEFVO15553 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEFVO15553 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEFVO15553 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEFVO15553 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEFVO15553 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEFVO15553 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEFVO15553 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MEFVO15553 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEFVO15553 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEFVO15553 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MEFVO15553 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEFVO15553 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEFVO15553 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEFVO15553 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEFVO15553 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MEFVO15553 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEFVO15553 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEFVO15553 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEFVO15553 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEFVO15553 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEFVO15553 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEFVO15553 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MEFVO15553 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEFVO15553 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEFVO15553 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEFVO15553 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEFVO15553 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEFVO15553 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEFVO15553 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEFVO15553 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEFVO15553 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEFVO15553 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEFVO15553 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEFVO15553 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEFVO15553 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEFVO15553 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MEFVO15553 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEFVO15553 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEFVO15553 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEFVO15553 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEFVO15553 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEFVO15553 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MEFVO15553 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MEFVO15553 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEFVO15553 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEFVO15553 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEFVO15553 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEFVO15553 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEFVO15553 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEFVO15553 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEFVO15553 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MEFVO15553 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEFVO15553 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEFVO15553 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEFVO15553 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEFVO15553 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEFVO15553 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEFVO15553 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEFVO15553 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEFVO15553 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEFVO15553 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEFVO15553 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEFVO15553 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEFVO15553 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms