Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC01565O15544 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms