Protein–RNA interactions for Protein: O15119

TBX3, T-box transcription factor TBX3, humanhuman

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX3O15119 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TBX3O15119 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TBX3O15119 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TBX3O15119 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TBX3O15119 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TBX3O15119 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TBX3O15119 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TBX3O15119 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TBX3O15119 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TBX3O15119 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TBX3O15119 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TBX3O15119 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TBX3O15119 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TBX3O15119 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TBX3O15119 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TBX3O15119 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TBX3O15119 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TBX3O15119 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TBX3O15119 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TBX3O15119 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TBX3O15119 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TBX3O15119 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TBX3O15119 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TBX3O15119 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TBX3O15119 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TBX3O15119 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TBX3O15119 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TBX3O15119 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TBX3O15119 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TBX3O15119 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TBX3O15119 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TBX3O15119 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TBX3O15119 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TBX3O15119 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TBX3O15119 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TBX3O15119 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TBX3O15119 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TBX3O15119 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TBX3O15119 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TBX3O15119 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TBX3O15119 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TBX3O15119 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TBX3O15119 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TBX3O15119 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TBX3O15119 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TBX3O15119 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TBX3O15119 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TBX3O15119 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TBX3O15119 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TBX3O15119 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TBX3O15119 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TBX3O15119 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TBX3O15119 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TBX3O15119 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TBX3O15119 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TBX3O15119 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TBX3O15119 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TBX3O15119 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TBX3O15119 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TBX3O15119 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TBX3O15119 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TBX3O15119 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TBX3O15119 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TBX3O15119 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TBX3O15119 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TBX3O15119 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TBX3O15119 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TBX3O15119 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TBX3O15119 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TBX3O15119 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TBX3O15119 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TBX3O15119 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TBX3O15119 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TBX3O15119 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TBX3O15119 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TBX3O15119 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TBX3O15119 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TBX3O15119 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TBX3O15119 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TBX3O15119 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TBX3O15119 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TBX3O15119 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TBX3O15119 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TBX3O15119 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TBX3O15119 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TBX3O15119 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TBX3O15119 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TBX3O15119 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TBX3O15119 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TBX3O15119 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TBX3O15119 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TBX3O15119 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TBX3O15119 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TBX3O15119 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TBX3O15119 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TBX3O15119 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TBX3O15119 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TBX3O15119 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TBX3O15119 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TBX3O15119 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms