Protein–RNA interactions for Protein: O14894

TM4SF5, Transmembrane 4 L6 family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5O14894 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF5O14894 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms