Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CltaO08585 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CltaO08585 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CltaO08585 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CltaO08585 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CltaO08585 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CltaO08585 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CltaO08585 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CltaO08585 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CltaO08585 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CltaO08585 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CltaO08585 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CltaO08585 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CltaO08585 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CltaO08585 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CltaO08585 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CltaO08585 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CltaO08585 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CltaO08585 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CltaO08585 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CltaO08585 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CltaO08585 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CltaO08585 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CltaO08585 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CltaO08585 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CltaO08585 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CltaO08585 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CltaO08585 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CltaO08585 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CltaO08585 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CltaO08585 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CltaO08585 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CltaO08585 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CltaO08585 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CltaO08585 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CltaO08585 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CltaO08585 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CltaO08585 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CltaO08585 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CltaO08585 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CltaO08585 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltaO08585 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltaO08585 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltaO08585 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltaO08585 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltaO08585 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltaO08585 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CltaO08585 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CltaO08585 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CltaO08585 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CltaO08585 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CltaO08585 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CltaO08585 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CltaO08585 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CltaO08585 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CltaO08585 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CltaO08585 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CltaO08585 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CltaO08585 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CltaO08585 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CltaO08585 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CltaO08585 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CltaO08585 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CltaO08585 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CltaO08585 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CltaO08585 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CltaO08585 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CltaO08585 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CltaO08585 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CltaO08585 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CltaO08585 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CltaO08585 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CltaO08585 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CltaO08585 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CltaO08585 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CltaO08585 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CltaO08585 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CltaO08585 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CltaO08585 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CltaO08585 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CltaO08585 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CltaO08585 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CltaO08585 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CltaO08585 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CltaO08585 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CltaO08585 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CltaO08585 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CltaO08585 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CltaO08585 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CltaO08585 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CltaO08585 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CltaO08585 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CltaO08585 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CltaO08585 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CltaO08585 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CltaO08585 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CltaO08585 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CltaO08585 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CltaO08585 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CltaO08585 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms