Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf6O08584 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf6O08584 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf6O08584 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf6O08584 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klf6O08584 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Klf6O08584 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klf6O08584 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf6O08584 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf6O08584 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf6O08584 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms