Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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