Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm438B1ASB3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm438B1ASB3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms