Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms