Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ism1A2ATD1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ism1A2ATD1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms