Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms