Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klhdc3Q8VEM9 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms