Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms