Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC010551.3-201ENST00000563772 463 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms