Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP13-3Q3SY46 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms