Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CREMQ03060 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms