Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCP2P22307 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCP2P22307 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCP2P22307 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCP2P22307 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCP2P22307 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCP2P22307 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCP2P22307 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCP2P22307 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCP2P22307 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCP2P22307 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCP2P22307 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCP2P22307 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCP2P22307 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCP2P22307 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCP2P22307 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCP2P22307 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCP2P22307 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms