Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1P21675 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1P21675 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1P21675 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1P21675 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms