Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NFKB1P19838 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NFKB1P19838 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NFKB1P19838 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NFKB1P19838 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NFKB1P19838 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NFKB1P19838 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NFKB1P19838 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NFKB1P19838 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NFKB1P19838 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NFKB1P19838 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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