Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms