Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms