Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms