Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms