Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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CBFBQ13951 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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CBFBQ13951 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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CBFBQ13951 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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CBFBQ13951 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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CBFBQ13951 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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CBFBQ13951 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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CBFBQ13951 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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