Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
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