Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms