Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SYT1P21579 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYT1P21579 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYT1P21579 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYT1P21579 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYT1P21579 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYT1P21579 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYT1P21579 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYT1P21579 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYT1P21579 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYT1P21579 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SYT1P21579 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYT1P21579 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYT1P21579 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYT1P21579 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYT1P21579 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYT1P21579 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYT1P21579 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYT1P21579 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT1P21579 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT1P21579 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms