Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GP1BBP13224 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms