Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms