Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms