Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms