Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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FOXE3Q13461 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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FOXE3Q13461 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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FOXE3Q13461 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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FOXE3Q13461 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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FOXE3Q13461 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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