Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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GRIK2Q13002 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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GRIK2Q13002 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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GRIK2Q13002 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GRIK2Q13002 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GRIK2Q13002 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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GRIK2Q13002 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GRIK2Q13002 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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GRIK2Q13002 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK2Q13002 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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GRIK2Q13002 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK2Q13002 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK2Q13002 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK2Q13002 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK2Q13002 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK2Q13002 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK2Q13002 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK2Q13002 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK2Q13002 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK2Q13002 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK2Q13002 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK2Q13002 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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