Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CastP51125 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CastP51125 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CastP51125 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CastP51125 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CastP51125 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CastP51125 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CastP51125 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CastP51125 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CastP51125 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CastP51125 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CastP51125 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CastP51125 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CastP51125 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CastP51125 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CastP51125 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CastP51125 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms