Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms