Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VCLP18206 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VCLP18206 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VCLP18206 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms