Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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