Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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