Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms