Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GSCP56915 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GSCP56915 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GSCP56915 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GSCP56915 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GSCP56915 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GSCP56915 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GSCP56915 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GSCP56915 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GSCP56915 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GSCP56915 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GSCP56915 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms