Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms