Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCAO15360 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FANCAO15360 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FANCAO15360 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FANCAO15360 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FANCAO15360 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCAO15360 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCAO15360 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCAO15360 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCAO15360 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCAO15360 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCAO15360 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCAO15360 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCAO15360 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCAO15360 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCAO15360 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCAO15360 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCAO15360 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCAO15360 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCAO15360 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCAO15360 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCAO15360 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCAO15360 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCAO15360 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCAO15360 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCAO15360 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms