Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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VPS4AQ9UN37 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VPS4AQ9UN37 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VPS4AQ9UN37 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VPS4AQ9UN37 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VPS4AQ9UN37 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VPS4AQ9UN37 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VPS4AQ9UN37 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VPS4AQ9UN37 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPS4AQ9UN37 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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