Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms