Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms