Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms