Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 CD244-201ENST00000322302 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 LINC01830-201ENST00000450551 636 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 LINC00370-201ENST00000455487 698 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 SKA1-204ENST00000488454 669 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 AC108704.1-201ENST00000611714 744 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 AL445183.1-201ENST00000447867 467 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNKSR2Q8WXI2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms