Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms