Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC127071.1-201ENST00000624997 712 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LINC02525-202ENST00000435043 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 FABP1-201ENST00000295834 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LINC00114-202ENST00000429621 827 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC006042.1-201ENST00000449931 524 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 GNG2-216ENST00000615906 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AKR1C4-202ENST00000380448 1414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 KRTAP9-7-201ENST00000391354 1039 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 USP32P3-201ENST00000413270 1174 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC096543.2-201ENST00000449140 859 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms